W 1992 roku Mostar stał się areną bratobójczych walk. Walczyli Bośniacy z Chorwatami przeciwko Serbom, potem Chorwaci przeciwko Bośniakom. Większość z zabytków architektury została zniszczona, łącznie ze słynnym Starym Mostem.
Po wojnie miasto w znacznej części odbudowano, jednak wiele budynków pozostawiono w trwałej ruinie jako przestroga dla przyszłych pokoleń.